红旗渠自1962年至1992年共决口17次，有自然决口和人为破坏决口。自然决口形成原因大部分是由于渠底基础滑动引起。决口给人民财产造成很大损失。每次决口后，县委、县政府都十分重视，及时组织水力、物力，昼夜不停抢修，在最短的时间内修复通水。
一、自然决口
1968年10月14日，总干渠山西境内西老虎嘴段因渠基滑动，决口76米；1969年5月12日，总干渠山西境内姐妹桥东段，因山石坍塌阻塞渠道决口72米；1969年6月和1970年1月4日，山西境内东老虎嘴段因渠基滑动造成两次决口，决口长度分别是50米和35米；1972年4月13日，总干渠回山角段因渠基滑动决口50米；1972年10月4日，总干渠林英渡槽因外墙跨倒决口60米；1973年11月19日夜，总干渠赵所段发生滑坡决口70米；1976年11月14日，谷堆寺东因基础滑动决口74米。1981年8月18日总干渠王家庄村东因黄土渠基滑坡决口，后进行改线处理。
因山洪暴发造成渠道决口严重的是1982年汛期，是年7月29日至8月4日，7天时间内，全县普降大雨和暴雨，15个公社中有8个公社降雨在500毫米以上，石板岩公社降雨量达1156.5毫米，其中8月1日6时至2日6时的24小时内，降雨462.8毫米。连降大雨，山洪暴发，河水猛涨，8月1日，露水河阳耳庄段洪峰流量1500立方米／秒，浙河合涧段1’400立方米／秒。南谷洞水库8月1日8时20分，进库最大洪峰1600立方米／秒，11时溢洪道流水深5.19米，泄量870立方米／秒；弓上水库8月1日6时，进库最大洪峰1346立方米／秒，溢洪道水深2.94米，泄量1307立方米／秒。
县境内遭受严重洪水灾害，受灾面积23.8万亩。红旗渠总干渠和一、二、三干渠等主要干渠，普遍遭到洪水冲击。渠里岸滑坡、塌方和渠墙倒塌相当严重，共倒渠墙818处，长11291米，冲毁桥梁、涵洞18个，塌方淤积25处。较大滑坡和塌方地段是总干渠首、二号闸门、林英洞、东老虎嘴、白家庄猴崭等处，每处塌方都有2000立方米上下，最大的是猴崭西一处塌方在5000立方米以上。总干渠南谷洞渡槽上游30米处外渠墙决口70米，南谷洞水库引水渠被溢洪道渲泄的870立方米／秒的洪水冲垮90余米，致使水库放水不能输入总干渠。总干渠南谷洞渡槽在洪水面距拱顶只有50厘米即将被冲垮的情况下幸存下来，但渡槽拱脚根基被冲掉根。空心坝护滩被冲垮。此外，红旗渠一、二、三干渠，红英干渠等都有不同程度的淤塞倒塌。
抢险中，县政府成立水毁复修工程总指挥部，县长赵俊杰、副县长刘银良任总指挥。总指挥部设在红旗渠管理处，下设4个分指挥部，即红旗渠总干渠山西段指挥部，驻山西省平顺县王家庄；总干渠林县段指挥部。驻回山角管理所南庄庙管理段；一、二、三干渠施工分指挥部驻分水岭红旗渠管理处；淇河渠施工分指挥部。从县直各局委抽出20余名科、局长充实各分指挥部。15个分指挥部，各公社主要负责人分为两套，一套由管委会主任或副主任挂帅奔赴工地，坐镇指挥；一套由党委书记或工财主任在家保证后勤，催人、催物、催车，及时解决具体间题，切实做到前方有求，后方必应。
自力更生，抗灾抢险。在任务分配上，急事急办，按亩均摊，划段包干，此次施工单独核算，不和以前红旗渠老帐投工余缺平衡。为了方便施工，减少住房困难，在分配任务时，凡在本公社内的工程由本社承担，总干渠任务补齐，先远后近，先上后下，先急后缓。工程量大，经济物料短缺，人民群众不坐等投资，自筹资金，争取主动，争取时间。县里负责解决水泥、石灰、炸药、钢材四项主要材料，公社负责解决民工生活、搭设工棚、工具物料、搭架木材、往返运输费等。
表彰抗洪抢险模范，学习英雄人物。8月20日，县委、县政府召开全县抗洪抢险表彰大会，对抗洪抢险中涌现出来的13个先进集体、45个模范个人进行了表彰，并将他们的模范事迹在全县广播。河南省政府召开全省抗洪抢险总结表彰大会时，林县水利局工程师宋涛和红旗渠管理处党总支书记刘录生被评为河南省抗洪抢险劳动模范，受到省政府的表彰。
二、人为决口
人为炸渠决口，主要是河南、河北两省边界地区为利用漳河水予盾引起的。损失是惨重的，教训是深刻的。
1984年1月9日，山西省平顺县石城村在红旗渠首拦河坝左侧动工建电站，本来红旗渠已经很少的水源，又要减少2-3个流量，面临断流危险。林县群众十分恐慌，引起强烈反响。为了制止石城开渠引水建电站，林县县委、县政府和安阳市委、市政府派人到山西省多方面协商十六次，均无效果。新华社记者到红旗渠首看了现场后，向中央作了反映。4月1日，时任中共中央总书记的胡耀邦批示：“请李鹏同志指定人细心查明这个问题，查得一清二楚之后再商有关地区同志妥为解决。”时任国务院总理的赵紫阳批示：“水电部正英同志：红旗渠既已建成，且国内外都有影响。因此上游搞什么工程必须统一考虑，照顾红旗渠用水，请予干预。”同年4月9日，水电部水规院吴以鳌院长等6人到林县落实总书记、总理批示。未果。后来，林县、安阳市、河南省政府又多次向上级反映这一问题。1986年12月10日，海河委员会下文《关于山西省平顺县石城小电站初步设计的批复》，同意该小电站建设。林县干部群众十分震惊，议论纷纷，继续要求上级妥为解决。之后，水源矛盾日趋紧张，林县天桥渠数次被炸毁。红旗渠也几次被炸。
1992年8月22日总干渠盘阳段决口，就是被人为炸毁决口的，损失惨重。第一处炸塌高8米的渠墙25米，第二处炸塌高8米的渠墙6米；两处总长31米的渠墙被彻底摧毁，60多米渠墙发生移位、裂缝和松动，红旗渠全线断流。干渠被炸后，渠水以74立方米／秒流量,90米高的落差，咆哮着直泄林县盘阳村的田野、村庄。熟睡的群众被震耳的爆炸声和洪水巨大的冲击声惊醒，四散逃生。大片的房屋、耕地被冲毁。大面积快成熟的秋作物被从山上冲下的乱石覆盖，二三吨重的巨石被水冲滚数十米远，合抱粗的大树连根拔起，树皮被水流乱石剥光。盘阳村投资105万元、年产值150万元的铸造厂厂房、设备、原料、成品、帐目被洪水冲得荡然无存，成为一片废墟；不少农家猪圈、鸡窝仅剩下一点墙基。
据统计，这次人为的破坏使230亩耕地被冲毁，700多亩秋庄稼被淹，600多间民房、8家企业遭水灾，大批猪、鸡被淹死，直接损失达1000多万元。
当时，正值渠道引水灌溉保秋、蓄水灌库的关键时刻，渠道被炸断流以后，依靠红旗渠吃水的32万名群众生活用水困难；县、乡、村三级企业50多家也因水源断流而停产。受害群众强烈要求党和政府抓紧侦破，惩办案犯，确保红旗渠免遭再次破坏和人民群众的生命财产安全。
中共林县县委、县政府一方面对受灾地区农民作了大量思想工作，努力恢复生产和生活；一方面组织红旗渠灌区管理局的干部职工300余人进行抢险复修，日夜奋战，于9月2日恢复通水。
红旗渠被炸事件发生后，《农民日报》、《中国环境报》、《河南日报》、安阳电视台、《热风》杂志等，都先后报道了这次事件的经过，各级领导十分重视，认为：这起炸渠事件是因河南、河北两省边界地区为利用漳河水多年矛盾未解决而酿成的。决口给人民生命财产造成巨大损失，为建国以来罕见的炸毁水利工程事件，中共中央总书记江泽民、国务院总理李鹏为解决此事件作了批示。
1992年9月29日上午，国务院在北京召开了晋、豫、冀三省漳河水事纠纷协调会，国务院副总理田纪云、国务院办公厅副秘书长李昌安、水利部部长杨振怀、副部长张春园，以及海河委员会、漳卫南运河管理局负责人，国家财政部、公安部等有关单位；河南、河北、山西三省分管农村工作的副省长、副秘书长、水利厅长；安阳市、邯郸行署、长治市副市长、水利局长；林县、涉县、磁县、安阳县、平顺县的县长等共40人。
会议由李昌安副秘书长主持，田纪云副总理作了重要讲话，张春园副部长讲了具体意见，会议形成了《漳河水事会议纪要》。
《纪要》称：漳河跨晋、豫、冀三省，流域内水资源和耕地Iff乏，地区之间为争夺水源和围河造地矛盾旷日持久，随着社会经济的发展，供需矛盾日益尖锐，已严重影响了这一地区的安定团结，给国家和人民财产造成损失。最近红旗渠被炸的严重事件表明漳河水事纠纷已到了非解决不可的程度。
《纪要》说：解决漳河水事纠纷，合理开发利用漳河水资源，根本出路在于实施统一管理，计划用水，节约用水。会议决定，由水利部海河水利委员会对漳河侯壁水电站至岳城水库间河段实行统一规划，统一治理，统一调度，统一管理。红旗渠、跃进渠、白荃渠（一、二道渠）、大跃峰渠、小跃峰渠等六条渠道的引水坝渠首节制闸及石城电站引水渠节制闸、马塔电站原水渠节制闸，移交海河水利委员会。设立漳河上游管理局，漳河上游管理和分水方案的实施，组织河道的综合开发治理，由漳河上游管理局按经批准的河道治理规划，组织沿河各县统一治理开发漳河。国家和晋、冀、豫三省要重点扶持这一地区的节水工作。今后在漳河侯壁水电站至岳城水库之间河道及分水控制工程以上引水渠上，凡是新建、改建、扩建大小水利水电工程，一律报漳河上游管理局，按规定程序审核批准后实施。水利部与河北、山西、河南组成漳河水事协调小组，协调漳河水事中的重大问题。对于破坏水利工程案件的查处，公安部抓紧进行，依法严肃处理。
《人民日报》、中央电视台（新闻联播节目）、（中国水利报》、《河南日报》等报道了这次会议情况。
红旗渠总干渠决口事故统计表
|
顺序 |
决口时间 |
决口地点 |
所在桩号 |
决口长度(米) |
决 口 原 因 |
|
1 |
1962.7.8 |
木家庄村西 |
29+480 |
60 |
|
|
2 |
1963.1 2 |
马牙沟东坡 |
26+140 |
50 |
|
|
3 |
1965.4.5 |
河口村东涵洞 |
21+315—21+335 |
20 |
从涵洞顶漏水开始 |
|
4 |
1966.12.5 |
马牙沟西坡 |
25+220—25+256 |
36 |
基础滑动 |
|
5 |
1968.10.14 |
西老虎嘴 |
12+620 |
76 |
基础滑动 |
|
6 |
1969.5.12 |
姐妹桥东 |
4+400 |
72 |
上边坍塌档渠决口 |
|
7 |
1969.6.10 |
东老虎嘴 |
14+500 |
50 |
基础滑动 |
|
8 |
1970.1.4 |
东老虎嘴 |
14+400 |
35 |
基础滑动 |
|
9 |
1972.4.1 3 |
回山角 |
60+240 |
50 |
基础滑动 |
|
10 |
1972.10.4 |
克昌桥(林英渡槽) |
5+685—5+745 |
60 |
渡槽左渠墙倒塌 |
|
11 |
1973.11.19夜 |
赵所（羊圈坡村下) |
约35+675 |
70 |
基础滑动 |
|
12 |
1974.5.2 |
南谷洞渡槽 |
约53+175 |
50 |
渡槽北渠墙倒塌 |
|
13 |
1976.11.14 |
谷堆寺东边 |
16—500 |
74 |
基础滑动 |
|
14 |
1981.8.18 |
王家庄村东 |
l1+319—11+359 |
40 |
基础滑动 |
|
15 |
1982.8.16 |
南谷洞渡槽上游 |
约53+000 |
60 |
山洪暴发、渠道堵塞，漫溢决口 |
|
16 |
1988.7.8 |
石界村南猴崭北边 |
48+480 |
30 |
基础滑坍 |
|
17 |
1992.8.22 |
盘阳洞南 |
33+707—33+762 |
60 |
人为破坏炸毁决口两处 |
